1996年(001~042)
  ※001 云霄飞车杀人事件 
  002 社长千金诱拐事件 
  003 偶像密室杀人事件 
004 大都会暗号地图藏宝事件 
※005 新干线大爆炸事件 
  006 情人节杀人事件◆ 
  007每月一份礼物威胁事件 
  008 美术馆杀人事件 
  009 天下第一夜祭杀人事件 
  010 足球选手恐吓事件 
  011 钢琴奏鸣曲月光杀人事件★ 
  012 步美被绑事件 
  013 奇怪的寻人事件 
  014 谜样的讯息狙击事件◆ 
  015消失的尸体杀人事件 
  016 古董收藏家杀人事件 
  017 百货公司挟持事件◆ 
  018六月新娘杀人事件 
  019 电梯杀人事件◆ 
  020鬼屋杀人事件 
  021 电视台外景队杀人事件◆ 
  022豪华客轮连续杀人事件(前篇) 
  023 豪华客轮连续杀人事件(后篇) 
  024 丧失记忆的美少女事件 ◆ 
  025真假人质绑票事件◆ 
  026小五郎同学会杀人事件(前篇) 
  027 小五郎同学会杀人事件(后篇) 
  028 爱犬约翰杀人事件◆ 
  029 计算机杀人事件◆ 
  030不在场证明杀人事件◆ 
  031电视台杀人事件 
  032 咖啡厅杀人事件 
  033 侦探团生还事件◆ 
  034山庄绷带怪人杀人事件(前篇) 
  035 山庄绷带怪人杀人事件(后篇) 
  036 星期一晚上7:30杀人事件◆ 
  037仙人掌花杀人事件◆ 
  038红鬼村火祭杀人事件 
  039 优胜锦旗被割事件◆ 
  040企业家千金杀人事件(前篇) 
  041 企业家千金杀人事件(后篇) 
  042 卡拉OK厅杀人事件
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1997年(043~085)
  043 江户川柯南诱拐事件 
  044 三兄弟杀人事件◆ 
  045敷面膜杀人事件◆ 
  046雪山山庄杀人事件 
  047 健身俱乐部杀人事件◆ 
  048外交官杀人事件(前篇) 
  049 外交官杀人事件(后篇) 
  050 图书馆杀人事件 
  051 高尔夫练习场杀人事件 ◆ 
  052 雾天狗传说杀人事件★ 
  053神秘凶器杀人事件 ◆ 
※054 电玩公司杀人事件 
  055 列车手法杀人事件 ◆ 
  056清洁车杀人事件 ◆ 
  057福尔摩斯迷杀人事件(前篇) 
  058 福尔摩斯迷杀人事件(后篇) 
  059 第一次购物杀人事件 ◆ 
  060插画画家杀人事件 
  061 幽灵船杀人事件(前篇)◆ 
  062幽灵船杀人事件(后篇)◆ 
  063大怪兽哥斯拉杀人事件 
  064 第三个指纹杀人事件 ◆ 
  065螃蟹和鲸鱼事件 ◆ 
  066夜路杀人事件 ◆ 
  067舞台女演员杀人事件 ◆ 
  068暗夜公爵杀人事件(事件篇) 
  069 暗夜公爵杀人事件(疑惑篇) 
  070 暗夜公爵杀人事件(解决篇) 
  071 痴恋狂杀人事件 ◆ 
  072三胞胎别墅杀人事件 
  073 少年侦探团遇难事件◆ 
  074死神阵内杀人事件◆ 
  075金融公司社长杀人事件 
  076 柯南VS怪盗基德★ 
  077名门连续惨死事件（前篇） 
  078 名门连续惨死事件（后篇） 
  079 银行抢匪杀人事件◆ 
  080流浪画家杀人事件◆ 
  081当红歌星事件（前篇） 
  082 当红歌星事件（后篇） 
  083 综合医院杀人事件 ◆ 
  084滑雪别墅杀人事件(前篇) 
  085 滑雪别墅杀人事件(后篇)
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1998年(086~128)
  086 诱拐现场特定事件 
  087 白鹤报恩杀人事件 ◆ 
  088德休拉别墅杀人事件(前篇)◆ 
  089德休拉别墅杀人事件(后篇)◆ 
  090花香杀人事件 ◆ 
  091强盗犯人住院事件 
  092 恐怖登山杀人事件(前篇)◆ 
  093恐怖登山杀人事件(后篇)◆ 
  094雪女传说杀人事件◆ 
  095小五郎约会杀人事件◆ 
  096走投无路的名侦探！连续两大杀人事件★ 
  097离别美酒杀人事件◆ 
  098名陶艺家杀人事件（前篇） 
  099 名陶艺家杀人事件（后篇） 
  100 初恋情人回忆事件（前篇） 
  101 初恋情人回忆事件（后篇） 
  102 古装演员杀人事件（前篇） 
  103 古装演员杀人事件（后篇） 
  104 盗贼集团别墅事件（前篇） 
  105 盗贼集团别墅事件（后篇） 
  106 新闻照片杀人事件◆ 
  107鼹鼠星人之谜事件(前篇)◆ 
  108鼹鼠星人之谜事件(后篇)◆ 
  109侦探团大追击事件 ◆ 
  110烹饪教室杀人事件(前篇)◆ 
  111烹饪教室杀人事件(后篇)◆ 
  112帝丹小学七大离奇事件 
  113 白海滩杀人事件 
  114 有氧潜水杀人事件(前篇) 
  115 有氧潜水杀人事件(后篇) 
  116 推理小说家失踪事件(前篇) 
  117 推理小说家失踪事件(后篇) 
  118 浪花连续杀人事件★ 
  119假面超人杀人事件◆ 
  120蜜蜂鸡尾酒杀人事件◆ 
  121浴室密室事件(上集) 
  122 浴室密室事件(下集) 
  123 天气预报小诱拐事件◆ 
  124神秘的狙击者杀人事件(前篇)◆ 
  125神秘的狙击者杀人事件(后篇)◆ 
  126旅行戏团杀人事件(前篇)◆ 
  127旅行戏团杀人事件(后篇)◆ 
※128黑衣组织10亿元抢劫事件
∙
1999年(129~173)
  ※129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件★ 
  130竞技场无差别胁迫事件(前篇) 
  131 竞技场无差别胁迫事件(后篇) 
  132 魔术爱好者杀人事件(事件篇) 
  133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇) 
  134 魔术爱好者杀人事件(解决篇) 
  135 消失的凶器搜索事件 ◆ 
  136青古堡探索事件(前篇) 
  137 青古堡探索事件(后篇) 
  138 最终播映杀人事件(前篇) 
  139 最终播映杀人事件(后篇) 
  140 SOS！步美传达的讯息◆ 
  141结婚前夜密室事件(前篇) 
  142 结婚前夜密室事件(后篇) 
  143 疑惑的天体观测 ◆ 
  144上野出发的北斗星3号(前篇) 
  145 上野出发的北斗星3号(后篇) 
146 本厅刑事恋爱物语(前篇) 
147 本厅刑事恋爱物语(后篇) 
  148 路面电车紧急煞车事件 ◆ 
  149游乐园高空弹跳事件 ◆ 
  150汽车爆炸事件的真相(前篇)◆ 
  151汽车爆炸事件的真相(后篇)◆ 
  152神秘老人失踪事件 ◆ 
  153园子的夏日海滩冒险物语(前篇) 
  154 园子的夏日海滩冒险物语(后篇) 
  155 水中的钥匙密室事件◆ 
  156本厅刑事恋爱物语2(前篇) 
  157 本厅刑事恋爱物语2(后篇) 
  158 沉默的环状线 ◆ 
  159诡异的五重塔传说(前篇)◆ 
  160诡异的五重塔传说(后篇)◆ 
  161流过流水亭的杀机 ◆ 
  162飞天密室 工藤新一最初的事件★ 
  163月亮、星星与太阳的秘密(前篇) 
  164 月亮、星星与太阳的秘密(后篇) 
  165 少年侦探队消失事件 ◆ 
  166鸟取县蜘蛛公馆的怪事(事件篇) 
  167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(疑惑篇) 
  168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(解决篇) 
  169 维纳斯之吻 ◆ 
  170黑暗中的死角(前篇) 
  171 黑暗中的死角(后篇) 
  172 复活的死亡讯息(前篇) 
  173 复活的死亡讯息(后篇)
∙
2000年(174~218)
  174 二十年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件★ 
  175惨遭四次杀害的男子◆ 
※176 与黑暗组织的再会(灰原篇) 
  ※177 与黑暗组织的再会(柯南篇)
  ※178 与黑暗组织的再会(解决篇)
  179 咖啡厅卡车撞入事件◆ 
  180红的杀机夜想曲(前篇)◆ 
  181红的杀机夜想曲(后篇)◆ 
  182第九个门大搜查 ◆ 
  183危险的处方笺◆ 
  184诅咒假面的冷笑★◆ 
  185被狙击的名侦探(前篇)◆ 
  186被狙击的名侦探(后篇)◆ 
  187在黑暗中传出的神秘声 ◆ 
  188危命的复活 洞窟内的侦探团 
  189 危命的复活 负伤之下的名侦探 
  190 危命的复活 第三个选择 
  191 危命的复活 黑衣骑士 
  192 危命的复活 新一回来了 
  193 危命的复活 约定的场所 
  194 别有玄机的八音盒(前篇) 
  195 别有玄机的八音盒(后篇) 
  196 看不见的凶器，小兰的初次推理 ◆ 
  197超级汽车陷阱(前篇)◆ 情人节几月几号
  198超级汽车陷阱(后篇)◆ 
  199嫌疑犯，毛利小五郎(前篇) 
  200 嫌疑犯，毛利小五郎(后篇) 
  201 第10个乘客(前篇)◆ 
  202第10个乘客(后篇)◆ 
  203依卡路斯的黑之翼(前篇)◆ 
  204依卡路斯的黑之翼(后篇)◆ 
  205本厅刑事恋爱物语3(前篇) 
  206 本厅刑事恋爱物语3(后篇) 
  207 太过顺利的推理 ◆ 
  208迷宫的入口 巨大神像的愤怒★◆ 
  209龙神山坠落事件 ◆ 
  210五彩传说的水底龙宫(前篇)◆ 
  211五彩传说的水底龙宫(后篇)◆ 
  212松茸、熊与侦探队(前篇) 
  213 松茸、熊与侦探队(后篇) 
  214 怀古饭店的神秘事件◆ 
  215复仇海滩(前篇)◆ 
  216复仇海滩(后篇)◆ 
  217目暮尘封的秘密(前篇) 
  218 目暮尘封的秘密(后篇)
∙
2001年(219~262)
  219 被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德★ 
  220满口谎言的委托人(前篇) 
  221 满口谎言的委托人(后篇) 
  222 人鱼失踪记(事件篇) 
  223 人鱼失踪记(推理篇) 
  224 人鱼失踪记(解决篇) 
  225 生意兴隆的秘密 ◆ 
  226格斗游戏的陷阱(前篇) 
  227 格斗游戏的陷阱(后篇) 
  228 暗藏杀机的陶艺教室(前篇) 
  229 暗藏杀机的陶艺教室(后篇) 
  ※230 谜一样的乘客(前篇) 
  ※231 谜一样的乘客(后篇) 
  232 公寓坠落事件 ◆ 
  233无法消灭的证据(前篇) 
  234 无法消灭的证据(后篇) 
  235 酒窖密室事件 ◆ 
  236南纪白滨的神秘之旅(前篇)◆ 
  237南纪白滨的神秘之旅(后篇)◆ 
  238大阪3K事件(前篇) 
  239 大阪3K事件(后篇) 
  240 新干线护送事件(前篇) 
  241 新干线护送事件(后篇) 
  242 元太少年的灾难 
  243 毛利小五郎的冒充者(前篇) 
  244 毛利小五郎的冒充者(后篇) 
  245 向日葵公馆的声 ◆ 
  246缠在网中的谜团(前篇) 
  247 缠在网中的谜团(后篇) 
  248 治愈之森的不在场证明 ◆ 
  249偶像们的秘密(前篇) 
  250 偶像们的秘密(后篇) 
  251 OK牧场的悲剧 ◆ 
  252在图画里的犯 ◆ 
  253本厅刑事恋爱物语4(前篇) 
  254 本厅刑事恋爱物语4(后篇) 
  255 松江玉造连句十四回合定胜负(前篇)◆ 
  256松江玉造连句十四回合定胜负(后篇)◆ 
  257奇怪的天谴 ◆ 
※258 来自芝加哥的男子(前篇) 
  ※259 来自芝加哥的男子(后篇) 
  260 摇晃的餐厅◆ 
  261降雪之夜的恐怖传说(前篇)◆ 
  262降雪之夜的恐怖传说(后篇)◆
∙
2002年(263~303)
  263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁之城★ 
  264法庭上的对决 妃VS小五郎 (前篇)◆ 
  265法庭上的对决 妃VS小五郎 (后篇)◆ 
  266情人节的真相(事件篇) 
  267 情人节的真相(推理篇) 
  268 情人节的真相(解决篇) 
  ※269 犯罪的遗物 (前篇) 
  ※270 犯罪的遗物 (后篇) 
  ※271 隐藏匆忙中的省略(前篇) 
  ※272 隐藏匆忙中的省略(后篇) 
  273 猜谜婆婆失踪事件 ◆ 
  274幽灵屋的真相(前篇) 
  275 幽灵屋的真相(后篇) 
  276 警察手册丢失事件 ◆ 
※277 英语教师VS西部名侦探(前篇) 
  ※278 英语教师VS西部名侦探(后篇) 
  ※279 迷宫的阴暗(前篇) 
  280 迷宫的阴暗(后篇) 
  281 年幼的目击者 ◆ 
  282水流石庭的玄机(前篇)◆ 
  283水流石庭的玄机(后篇)◆ 
※284 中华街雨中的似曾相识(前篇) 
  ※285 中华街 雨中的似曾相识(后篇) 
  ※286 工藤新一纽约事件(事件篇)
  ※287 工藤新一纽约事件(推理篇)
※288 工藤新一纽约事件(解决篇) 
  ※289 迷惘森林中的光彦(前篇) 
  ※290 迷惘森林中的光彦(后篇) 
  291 孤岛的公主与龙宫城(事件篇) 
  292 孤岛的公主与龙宫城(追求篇) 
  293 孤岛的公主与龙宫城(解决篇) 
  294 爱与决心的粉碎(前篇)◆ 
  295爱与决心的粉碎(后篇)◆ 
  296屋形船海钓记 ◆ 
  297法庭的对决II 妃英理VS九条(前篇)◆ 
  298法庭的对决II 妃英理VS九条(后篇)◆ 
  299友情与杀意的关门海峡(前篇)◆ 
  300友情与杀意的关门海峡(后篇)◆ 
  301恶意与圣者的行进(前篇) 
  302 恶意与圣者的行进(后篇) 
  303归来的受害者